Tra le sue finalità principali, il CUE si prefigge di raccogliere, catalogare e rendere disponibili alla comunità scientifica (e a pubblici più ampi) collezioni di materiali relativi all'opera di Umberto Eco, importanti ai fini della documentazione complessiva del suo lavoro.
Il Centro sta attualmente esplorando accordi di collaborazione con altri archivi, finalizzati a censire la vasta produzione di Eco, non solo in ambito accademico, ma anche in relazione alle sue diverse attività, compresa quella editoriale.
Il Progetto Archivio Umberto Eco è in corso di elaborazione e prevede diversi sotto-progetti; attualmente sono in fase di sviluppo l’Archivio degli Archivi, l’Index Humbertinus e i libri annotati di Umberto Eco.
Inoltre, il CUE registra e rende disponibili, attraverso il proprio archivio video, alcuni degli eventi organizzati dal Centro.
AGGIORNAMENTO (03/02/2021): La Biblioteca Universitaria di Bologna ospiterà la collezione libraria moderna e l'archivio appartenuti al Prof. Umberto Eco.